Senioringeniør bioinformatikk ved Klinisk institutt 2
Universitetet i Bergen
- Frist 19.2.2023
- Ansettelsesform Fast
Er du vår nye bioinformatiker?
Kunnskap som formar samfunnet
Gjennom eit sterkt og tett samspel med omverda - globalt, nasjonalt og lokalt - skal vi medverke til eit samfunn bygd på kunnskap, ferdigheiter og haldningar.
Vil du vere med å forme framtida?
Video: https://youtu.be/vtJLmcUJ3-w (https://youtu.be/vtJLmcUJ3-w)
Senioringeniør
Ved Det medisinske fakultet, Klinisk institutt 2, er det ledig ei fast stilling som senioringeniør (100%; bioinformatikar). Stillinga er tilknytta UiB Genomikk-kjernefasiliteten (GCF) som er lokalisert i 6. etasje i Laboratoriebygget ved Haukeland Universitetssjukehus. GCF tilbyr tenester for global genekspresjonsanalyse og genomisk DNA-sekvensering ved hjelp av Next Generation Sequencing (NGS)-teknologi.
Arbeidsoppgåver:
- Utføre bioinformatiske tenester for GCF brukarar, slik som planlegging av eksperimentell design og analyse av NGS-data (korte og lange leselengder) frå eksom-sekvensering, helgenom-sekvensering, RNA-sekvensering, single cell-sekvensering og 16S-metagenom-sekvensering.
- Vedlikehald og utvikling av system for datalagring og behandling (loggføring, rapportering, deling, overføring og sletting av NGS-data.
- Utvikle, oppdatere og teste ulike analyseverktøy og bioinformatiske pipelines.
- Opplæring og halde foredrag (t.d. forelese på kurs og workshops).
Det kan verte aktuelt å leggje andre oppgåver til stillinga.
Kvalifikasjonar og eigenskapar:
- Søkjar må ha mastergrad innanfor bioinformatikk eller eit liknande fagområde.
- Må ha god kunnskap om og brei erfaring med ulike programmeringsspråk (t.d. Python, R, shell/awk, scripting) og teknologiar (t.d. git og docker).
- Må ha god kunnskap om bioinformatiske verktøy og pipelines for handtering og analyse av NGS-data (t.d. GATK, FastQC, BWA, SAM-tools, HiSat, STAR, Cellranger, Annovar, VEP og R/Python-pakkar for analyse og visualisering av NGS-data).
- Må kunne handtere Linux-baserte operativsystem.
- Må ha praktisk erfaring med analyse av eksomdata, helgenomdata og/eller RNA-seq-data.
- Det er ynskeleg med kunnskap om Nextflow, snakemake og singularity.
- Det er ein føremon med erfaring med bruk av relevante databasar (t.d. NCBI, ENSEMBL, DDBJ, ClinVar) og/eller DRAGEN Bio-IT plattform.
- Må kunne kommunisere flytande munnleg og skriftleg på engelsk. Kunnskap i norsk eller andre skandinaviske språk er eit føremon.
Vi søkjer ein person som
- Er imøtekomande, vennleg og ansvarsbevisst og som er høgt motivert for å utføre bioinformatiske tenester for GCF sine brukarar.
- Likar å arbeide på ein disiplinert, organisert og veldokumentert måte.
- Er flink til å kommunisere og samarbeide, og kan jobbe både sjølvstendig og i team.
- Har god digital kompetanse og evne til å tileigne seg nye ferdigheiter.
Ved vurdering av søkjaren vil vi leggje stor vekt på dei personlege eigenskapane som er naudsynte for stillinga.
Vi tilbyr:
- Spanande og utviklande arbeidsoppgåver i eit sterkt fagmiljø
- Løn i stilling som senioringeniør (kode 1181) er for tida kr 553 500 - 604 400 (lønssteg 60-65). Løn er brutto pr. år for ei fulltidsstilling i lønsregulativet til staten ved tilsetjing. For særleg kvalifisert søkjar kan det verte aktuelt å vurdere høgare løn.
- Medlemsskap i Statens pensjonskasse
- Gode velferdsordningar (https://www.uib.no/foransatte/17399/velferd)
Generell informasjon:
For meir informasjon om stillinga kan man kontakte: Professor Vidar M. Steen, Klinisk institutt 2. Telefon: 55975327. E-post: vidar.martin.steen@helse-bergen.no
To get the advertisement in English, please contact Core Facility Manager, Rita Holdhus (Rita.Holdhus@uib.no).
Opplysningar om søkjaren kan bli gjort offentlege sjølv om søkjaren har oppmoda om ikkje å bli ført på søkjarlista. Dersom oppmodinga ikkje blir teke til følgje, skal søkjaren varslast om dette.
Nærare om tilsettingsprosessen her (https://www.uib.no/hr/74251/ansettelsesprosessen).
Om arbeidsgiveren
Universitetet i Bergen er ein anerkjend utdannings- og forskingsinstitusjon, organisert i sju fakultet og omlag 54 institutt og faglege senter. Campus ligg i sentrale delar av Bergen med universitetsområde på Nygårdshøyden, Haukeland, Marineholmen, Møllendalsveien og Årstad.
Det medisinske fakultet består av fem institutt og sju senter. Les meir om fakultet og tilhøyrande institutt.
- Sektor: Offentlig
- Sted: Jonas Lies vei 91, 5021 Bergen
- Bransje: Forskning, utdanning og vitenskap, Offentlig administrasjon
- Stillingsfunksjon: Ingeniør, Ingeniør, Kjemiingeniør
- FINN-kode 288862002
- Sist endret